秦林通过审讯被俘白莲教徒，从口供中发现了不同寻常之处：
所有人都听清了田长老对神秘水手首领说的话，却没有一个人听出水手首领究竟说了什么内容；而判断对方口音时，“八岁时去过扬州”、“听见邻居夫妻用湘西话吵架”……事实上是俘虏们不约而同的选择了记忆中最模糊最生疏的方言，硬往那水手首领的头上套。
显然这是锦衣卫严刑逼供的结果，在重刑拷打下犯人只能把脑海中各种熟悉的方言一一排除开，最后把剩下那个记忆模糊、似是而非的答案招供出来，以求暂时逃脱刑讯。
捕获的白莲教徒来自大江南北，南直隶又是行商要津，北至朔漠、南到岭南、西到川边、东临大海的商客川流不息，这好几十名多在码头活动的渔民、船工常年接触各地商客，怎么可能没有一个人能准确听出那神秘水手首领的口音？
排除了一切不可能的答案，剩下的最后一个答案就是真相：神秘水手根本就没说中国话，他们来自海外！
秦林把船弄进船坞，排干闸室中的水露出船底，就真相大白了：虽然船舱内、甲板、桅杆等所有地方都被小心处理过，没有留下任何痕迹，但只有在海洋中才会生长的海藻、海蛎子等船底赘生物，则完全暴露了它的来历：不是来自某处内河、湖泊，而是从海外偷偷溜进长江的。
那群神秘水手航行技术不错，使用的船舶性能优良，相貌又和中国人相差不大，便可以把南洋诸国和西洋人排除在外，那么剩下唯一的可能，就是倭寇了！
此时宁波市舶司已罢，日本的朝贡贸易停了几十年，而戚继光平定倭寇也有十多年了，隆庆开海也是开在福建月港，只允许福建漳州、泉州的商民开展对外贸易，千里之外南直隶的普通百姓这辈子哪儿见过日本人、听过日本话？打破脑袋也没想到那边去，这才在锦衣卫拷打之下产生了各种互相矛盾的供述。
秦林把这些分析和盘托出。
雷公腾边听边点头，“秦兄弟年纪虽轻，经验却是老辣！老哥我佩服不尽哪。这次老弟又立了一功——不过老弟在蕲州破荆王府一案时便已上达天听，燕子矶一案奏报上去，必定简在帝心，将来青云直上是不消说的，这次的功劳倒不足挂齿了，哈哈哈哈……”
秦林闻弦歌而知雅意，破获燕子矶大案的功劳才是重头，这次虽然查出有倭寇参与，后续侦破却不是南京这边能够负责的，半吊子的些微功劳便让与雷公腾，就算酬谢他安排庚字所的肥缺吧！
“什么功劳？”秦林眨了眨眼睛，故作不解的道：“审讯不是由雷千户主持的吗？下官只是躬逢其适而已。”
雷公腾大笑，拍着秦林的肩膀连声道好：“老哥这次就承老弟的情了！今后庚字所，不，就算整个南京锦衣卫系统老弟有什么麻烦，只管来和我说！”
话一出口，雷公腾又觉得冒昧了点，现在秦林还是他下属，燕子矶大案上报朝廷，焉知圣旨下来又将如何？人家立的功劳可不小！
再说了，江陵相府那位千金，还有魏国公府的大小姐都和他关系匪浅，要是真成了哪家的乘龙快婿，老泰山拔根拔根汗毛下来也比他个锦衣千户的腰还粗啊！大明朝锦衣卫最大的头子刘守有对张居正惟命是从，而魏国公府看门的都有两个人挂着锦衣卫指挥佥事的衔头！
心头惴惴，雷公腾看了看秦林脸色并无异状，这才又高兴起来。
这起案子并不由南直隶方面的锦衣卫来查办，因为现在的金陵城内外已经找不到几个日本人了，根本就无从查起。
有明一朝，对外实行勘合贸易，日本、高丽等国不许自行来和中国人做生意，要领取朝廷发给的“勘合”（进出口许可证），以“朝贡”的名义前来经商，由市舶司予以接待。
嘉靖二年日本细川氏和大内氏分别持新旧两种勘合来到宁波入贡，但明市舶司官员只肯接待其中一家，于是两家为了争夺朝贡的权利在宁波大打出手，惹得朝廷震怒，停了勘合贸易，从那以后江南就只有倭寇，没有合法日商了。
十年前戚继光又平定了倭寇，现在别说南京城，整个江南也见不到日本人，要查案自然无从谈起。
倭寇平定，隆庆年间重新开了海禁，但仅限于福建月港，只能由泉州、漳州两地的商民参与贸易，要从正规渠道找日本人了解情况查办案情，就得移交给那边；另外中日走私贸易仍集中于浙江宁波一线，南京方面也要行文给那边的锦衣卫机构，让他们明察暗访。
这就不是秦林目前能理会的了，得等月港、宁波两处查到线索。
雷公腾兴冲冲的要去向上级复命，临别时他犹豫了一下，又把秦林拉到旁边，细声细气的道：
“老弟已是简在帝心，不日就要扶摇直上，又和张、徐两位……咳咳，这个就不说了，总之老弟前程远大得很，有些眼前的事情似乎不必太计较，耿定向和王本固是一党，两人手底下那群疯狗御史逮人就咬……老弟收支上为难的话，上交千户所的常例也可以减一减，老哥还是能做这点主的。”
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